Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tpm4Q6IRU2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm4Q6IRU2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms