Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ParpbpQ6IRT3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ParpbpQ6IRT3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms