Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt40Q6IFX3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt40Q6IFX3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt40Q6IFX3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms