Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Arhgap20Q6IFT4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.7 ms