Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hecw2Q6I6G8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hecw2Q6I6G8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hecw2Q6I6G8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms