Protein–RNA interactions for Protein: Q6A051

Atrnl1, Attractin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atrnl1Q6A051 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atrnl1Q6A051 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atrnl1Q6A051 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atrnl1Q6A051 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atrnl1Q6A051 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atrnl1Q6A051 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms