Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ric1Q69ZJ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ric1Q69ZJ7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ric1Q69ZJ7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms