Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrcc1Q69ZB0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrcc1Q69ZB0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms