Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkp4Q68FH0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp4Q68FH0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp4Q68FH0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms