Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctnna3Q65CL1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna3Q65CL1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms