Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Clcn1Q64347 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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Clcn1Q64347 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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Clcn1Q64347 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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Clcn1Q64347 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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Clcn1Q64347 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clcn1Q64347 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
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