Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ly6eQ64253 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ly6eQ64253 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms