Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pan3Q640Q5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pan3Q640Q5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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