Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a5Q63ZW6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a5Q63ZW6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms