Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vat1Q62465 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms