Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm20854Q62461 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm20854Q62461 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm20854Q62461 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm20854Q62461 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm20854Q62461 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm20854Q62461 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm20854Q62461 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm20854Q62461 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms