Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa13Q62424 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa13Q62424 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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