Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Supt6hQ62383 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt6hQ62383 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Supt6hQ62383 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms