Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrhQ62361 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrhQ62361 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrhQ62361 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrhQ62361 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrhQ62361 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrhQ62361 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrhQ62361 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrhQ62361 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrhQ62361 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrhQ62361 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TrhQ62361 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TrhQ62361 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TrhQ62361 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrhQ62361 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrhQ62361 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrhQ62361 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TrhQ62361 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TrhQ62361 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrhQ62361 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrhQ62361 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TrhQ62361 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms