Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf6Q62311 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms