Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SypQ62277 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SypQ62277 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SypQ62277 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SypQ62277 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SypQ62277 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SypQ62277 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SypQ62277 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SypQ62277 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SypQ62277 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SypQ62277 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SypQ62277 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SypQ62277 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SypQ62277 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SypQ62277 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SypQ62277 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SypQ62277 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SypQ62277 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SypQ62277 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SypQ62277 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SypQ62277 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SypQ62277 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SypQ62277 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SypQ62277 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SypQ62277 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SypQ62277 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SypQ62277 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SypQ62277 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SypQ62277 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SypQ62277 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SypQ62277 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SypQ62277 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SypQ62277 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SypQ62277 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SypQ62277 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SypQ62277 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SypQ62277 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SypQ62277 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SypQ62277 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SypQ62277 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SypQ62277 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SypQ62277 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SypQ62277 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SypQ62277 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SypQ62277 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SypQ62277 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SypQ62277 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SypQ62277 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SypQ62277 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SypQ62277 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SypQ62277 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SypQ62277 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SypQ62277 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SypQ62277 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SypQ62277 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SypQ62277 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SypQ62277 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SypQ62277 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SypQ62277 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SypQ62277 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SypQ62277 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SypQ62277 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SypQ62277 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SypQ62277 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SypQ62277 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SypQ62277 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SypQ62277 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SypQ62277 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SypQ62277 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SypQ62277 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SypQ62277 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SypQ62277 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SypQ62277 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SypQ62277 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SypQ62277 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SypQ62277 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SypQ62277 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SypQ62277 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms