Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttf1Q62187 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttf1Q62187 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms