Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Sema3cQ62181 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sema3cQ62181 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms