Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3bQ62177 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema3bQ62177 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms