Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phox2aQ62066 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2aQ62066 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms