Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga6Q61739 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga6Q61739 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga6Q61739 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms