Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccne1Q61457 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccne1Q61457 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccne1Q61457 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms