Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pde3bQ61409 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde3bQ61409 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde3bQ61409 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde3bQ61409 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde3bQ61409 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde3bQ61409 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde3bQ61409 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde3bQ61409 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde3bQ61409 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms