Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AcanQ61282 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AcanQ61282 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AcanQ61282 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AcanQ61282 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms