Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nell2Q61220 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nell2Q61220 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nell2Q61220 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms