Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irf9Q61179 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irf9Q61179 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irf9Q61179 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms