Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtcfQ61164 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcfQ61164 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms