Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpc6Q61143 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trpc6Q61143 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trpc6Q61143 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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