Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lamb3Q61087 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lamb3Q61087 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lamb3Q61087 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamb3Q61087 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamb3Q61087 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamb3Q61087 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamb3Q61087 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamb3Q61087 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamb3Q61087 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamb3Q61087 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lamb3Q61087 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms