Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinQ61043 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinQ61043 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NinQ61043 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinQ61043 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinQ61043 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinQ61043 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NinQ61043 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinQ61043 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NinQ61043 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinQ61043 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NinQ61043 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NinQ61043 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NinQ61043 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NinQ61043 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NinQ61043 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinQ61043 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinQ61043 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinQ61043 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinQ61043 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinQ61043 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NinQ61043 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinQ61043 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinQ61043 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinQ61043 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinQ61043 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinQ61043 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NinQ61043 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinQ61043 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NinQ61043 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinQ61043 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinQ61043 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinQ61043 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinQ61043 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinQ61043 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinQ61043 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinQ61043 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinQ61043 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinQ61043 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NinQ61043 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NinQ61043 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinQ61043 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinQ61043 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinQ61043 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NinQ61043 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NinQ61043 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinQ61043 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinQ61043 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinQ61043 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinQ61043 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NinQ61043 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NinQ61043 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NinQ61043 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NinQ61043 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinQ61043 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinQ61043 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinQ61043 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinQ61043 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinQ61043 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinQ61043 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinQ61043 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinQ61043 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NinQ61043 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinQ61043 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NinQ61043 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinQ61043 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NinQ61043 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinQ61043 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinQ61043 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NinQ61043 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinQ61043 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinQ61043 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinQ61043 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinQ61043 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinQ61043 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NinQ61043 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms