Protein–RNA interactions for Protein: Q60854

Serpinb6, Serpin B6, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb6Q60854 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Serpinb6Q60854 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Serpinb6Q60854 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms