Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r1bQ60829 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppp1r1bQ60829 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp1r1bQ60829 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms