Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3Q60803 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf3Q60803 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms