Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcf4Q60722 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf4Q60722 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tcf4Q60722 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf4Q60722 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf4Q60722 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf4Q60722 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf4Q60722 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf4Q60722 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms