Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ItgaeQ60677 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ItgaeQ60677 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms