Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClpbQ60649 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ClpbQ60649 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClpbQ60649 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClpbQ60649 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClpbQ60649 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClpbQ60649 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClpbQ60649 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClpbQ60649 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClpbQ60649 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClpbQ60649 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClpbQ60649 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ClpbQ60649 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClpbQ60649 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms