Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prdm1Q60636 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prdm1Q60636 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms