Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sema5bQ60519 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sema5bQ60519 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sema5bQ60519 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms