Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf123Q5XPI3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms