Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV7

Setd5, SET domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd5Q5XJV7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Setd5Q5XJV7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Setd5Q5XJV7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Setd5Q5XJV7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Setd5Q5XJV7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Setd5Q5XJV7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Setd5Q5XJV7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Setd5Q5XJV7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Setd5Q5XJV7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Setd5Q5XJV7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Setd5Q5XJV7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Setd5Q5XJV7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Setd5Q5XJV7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Setd5Q5XJV7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Setd5Q5XJV7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Setd5Q5XJV7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms