Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r196Q5SVD5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms