Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Sco1Q5SUC9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sco1Q5SUC9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Sco1Q5SUC9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Sco1Q5SUC9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Sco1Q5SUC9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Sco1Q5SUC9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Sco1Q5SUC9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Sco1Q5SUC9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sco1Q5SUC9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms