Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlha9Q5RJB0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlha9Q5RJB0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms