Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Taf3Q5HZG4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf3Q5HZG4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Taf3Q5HZG4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf3Q5HZG4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Taf3Q5HZG4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf3Q5HZG4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf3Q5HZG4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf3Q5HZG4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf3Q5HZG4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Taf3Q5HZG4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf3Q5HZG4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf3Q5HZG4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf3Q5HZG4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf3Q5HZG4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms