Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nlrc3Q5DU56 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nlrc3Q5DU56 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms